在溶液中能吸附带电质点或本身带有可解离基团的物质颗粒，如蛋白质、氨基酸等，pH值条件下，于直流电场中会受到电性相反的电极吸引而发生移动。不同物质的颗粒在电场中的移动速度除与其带电状态和电场强度有关外，还与颗粒的大小、形状和介质黏度有关。根据这一特征，应用电泳法便可以对不同物质进行定性或定量分析，或将混合物进行组分分析或单个组分提取制备，电泳仪正是基于上述原理设计制造的。
电泳的影响因素很多，主要有被分离物质的带电荷量多少、电场强度、缓冲液的pH值和离子强度及支持介质的化学惰性 。
使用方法
1. 用导线将电泳槽的两个电极与电泳仪的直流输出端联接，注意不要接反。
2. 电泳仪电源开关调至关的位置，电压旋钮转到小，根据工作需要选择稳压稳流方式及电压电流范围。
3. 接通电源，缓缓旋转电压调节钮直到达到的所需电压为止，设定电泳终止时间，此时电泳即开始进行。
4. 工作完毕后，应将各旋钮、开关旋至零位或关闭状态，并拨出电泳插头。
使用的注意事项
1. 电泳仪通电进入工作状态后，禁止人体接触电极、电泳物及其它可能带电部分，也不能到电泳槽内取放东西，如需要应先断电，以免触电。同时要求仪器有良好接地端，以防漏电。
2. 仪器通电后，不要临时增加或拨除输出导线插头，以防短路现象发生，虽然仪器内部附设有保险丝，但短路现象仍有可能导致仪器损坏。
3. 由于不同介质支持物的电阻值不同，电泳时所通过的电流量也不同，其泳动速度及泳至终点所需时间也不同，故不同介质支持物的电泳不要同时在同一电泳仪上进行。
4. 在总电流不超过仪器额定电流时（电流范围），可以多槽关联使用，但要注意不能超载，否则容易影响仪器寿命。
5. 某些情况下需检查仪器电泳输入情况时，允许在稳压状态下空载开机，但在稳流状态下须先接好负载再开机，否则电压表指针将大幅度跳动，容易造成不要的人为机器损坏。
6. 使用过程中发现异常现象，如较大噪音、放电或异常气味，须切断电源，进行检修，以免发生意外事故。
