为了保证控温精度的正确性，当机器安装后，或经过一段时间使用后，可按下述方法校对控温精度：将感温探头和标准温度计紧挨在一起，放在育芽箱内的上层。将育芽箱进行控制加温后，开始校对控温器上的旋扭指示值，分别指在1、2、3、4、5等处的准确控制温度值。但旋扭指在“1”上以后，对育芽箱内进行控制加温，观察指示灯。开始加温时，“加温指示灯”亮，“恒温指示灯”不亮。加温一段时间后，当“加温指示灯”熄灭，而“恒温指示灯”亮时，即表示育芽箱内温度达到控制温度值，这是读出标准温度计上的数值，即是旋扭指在“1”处的控制恒定温度值，记录后继续往下校对，直到将1-5各档的实际控制温度值全部校对完毕为止。
将种豆按常规浸泡好后放入育芽箱内的下水盘上（下水盘安放时要尽量保持水平），再将感温探头插入育芽箱顶的探头架上，将控温旋扭指在25-27度处。随后豆种开始萌发，此时可将自动喷淋间隔调到2-3小时喷淋一次，到芽长1厘米后，调到4-6小时配淋一次。调节的水温要比指定的温度高出3-5度，使喷水的温度与豆芽当时的温度基本一致为宜。
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